FINBB:n jäsenbiopankit
FINBB:n jäsenbiopankkeja on kahdeksan
FINBB:n jäsenbiopankkeja ovat kuusi julkisen terveydenhuollon sairaalabiopankkia (Auria Biopankki, Pohjois-Suomen Biopankki Borealis, Itä-Suomen Biopankki, Helsingin Biopankki, Keski-Suomen Biopankki ja Tampereen Biopankki), Oulun yliopiston Arctic Biopankki ja valtion omistama THL Biopankki.
Arctic Biopankki
Arctic Biopankki on Suomen uusin biopankki. Biopankki perustettiin Oulun yliopiston Pohjois-Suomen alueelta keräämistä laajoista väestöaineistoista. Pohjois-Suomen väestöaineistot muodostavat koko elinkaaren kattavan hyvinvointi- ja terveystutkimusohjelman, jonka tavoitteena on edistää väestön terveyttä ja hyvinvointia. Biopankki rekisteröitiin Fimean valtakunnalliseen biopankkirekisteriin 23.4.2020.
Biopankin johtaja: Minna Ruddock
Data/IT: Jari Jokelainen, laatu: Anu Outinen-Tuuponen, projektit: Maarit Kangas, viestintä: Maarit Kangas, tieteellinen johtaja: Minna Ruddock
Minna Ruddock
Tieteellinen johtaja / Biopankin johtaja
Auria Biopankki
Auria Biopankki on Suomen vanhin sairaalabiopankki. Aurian ovat perustaneet Turun yliopisto sekä Varsinais-Suomen, Satakunnan ja Vaasan sairaanhoitopiirit vuonna 2012. Auria sai toimiluvan Sosiaali- ja terveysalan lupa- ja valvontavirastolta Valviralta (nykyään Fimea) 10.3.2014. Aurialla on laaja kokemus sekä akateemisten tutkijoiden että lääke- ja diagnostiikkayrityslähtöisten tutkimusten toteuttamisesta.
Auria Biopankki on ensimmäinen suomalainen FINAS-akkreditointipalvelun akkreditoima biopankki B001, akkreditointivaatimus SFS-EN ISO 20387:2020. Tiedot akkreditoituun pätevyysalueeseen sisältyvästä biopankkitoiminnasta ja toimipaikoista ovat nähtävissä verkkosivuilta www.finas.fi.
Auria Biopankissa on yli 1,5 miljoonaa FFPE kudosnäytettä ja tuorekudoksia sekä veri-, plasma-, seerumi-, likvor- ja DNA-näytteitä. Valmista genotyyppidataa on saatavilla osasta näytteitä. Hoidon yhteydessä potilaista kertyvä kliininen tieto on yhdistettävissä biopankkinäytteisiin. Data on suurelta osin rakenteellisessa muodossa, tekstimuotoisen datan keräämistä varten Auriassa kehitetään ja käytetään louhinta-algoritmeja. Lisäksi Auria Biopankissa käytetään koneoppimismalleja ennustamaan digitoiduista kudosnäytteistä esimerkiksi syövän hoitovastetta. Auria voi myös kutsua suostumuksen antaneita näytteen luovuttajia kliinisiin tutkimuksiin esimerkiksi genotyyppitietoon ja kliinisiin muuttujiin perustuen.
Biopankin johtaja: Lila Kallio
Data/IT: Roosa Kallionpää, laatu: Virve Vainio, projektit: Merja Perälä, viestintä: Juha Mäkelä, tieteellinen johtaja: Merja Perälä
- Medisiina D
- Kiinanmyllynkatu 10
- 20520 Turku
- PL 52
- 20521 Turku
Lila Kallio
Biopankin johtaja
Auria Biopankki
[email protected]+358 50 578 0815
Helsingin Biopankki
Helsingin Biopankin ovat perustaneet Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiiri (HUS), Helsingin yliopisto, Kymenlaakson sairaanhoito- ja sosiaalipalvelujen kuntayhtymä (Carea) ja Etelä-Karjalan sosiaali- ja terveyspiiri (Eksote) tukemaan näiden alueiden tutkimuksen ja hoidon kehittämistä. HUS omistaa Helsingin Biopankin ja vastaa näytteiden sekä tietojen säilyttämisestä.
Helsingin Biopankin tutkimusalue on väestön terveyden edistäminen, tautimekanismeihin vaikuttavien tekijöiden tunnistaminen, sairauksien ehkäisy sekä väestön hyvinvointia tai terveyttä edistävien tai sairaanhoidossa käyttävien tuotteiden tai hoitokäytäntöjen kehittäminen. Biopankki rekisteröitiin Valviran (nykyään Fimea) valtakunnalliseen biopankkirekisteriin 21.4.2015.
Biopankin johtaja: Eero Punkka
Data/IT: Otto Manninen, laatu: Tiina Nurmela, projektit: Theresa Knopp, viestintä: Janita Niemelä, Otto Manninen, tieteellinen johtaja: Olli Carpen
- Haartmaninkatu 3 (4. krs)
- 00290 Helsinki
- PL 400
- 00029 HUS
Eero Punkka
Biopankin johtaja
Helsingin Biopankki
[email protected]+358 50 421 7659
Itä-Suomen Biopankki
Itä-Suomen Biopankin ovat perustaneet Pohjois-Savon sairaanhoitopiirin kuntayhtymä, Etelä-Savon sosiaali- ja terveyspalvelujen kuntayhtymä (Essote), Itä-Savon sairaanhoitopiirin kuntayhtymä, Siun sote – Pohjois-Karjalan sosiaali- ja terveyspalvelujen kuntayhtymä sekä Itä-Suomen yliopisto. Biopankin tutkimusala kattaa perustajajäsentensä sekä niiden ja sidosryhmien terveyden- ja sairaanhoidon erikoisalat. Itä-Suomen Biopankki tukee etenkin verenkierto-, aineenvaihdunta, tuki- ja liikuntaelimistön-, neurologisten- ja syöpäsairauksien sekä mielenterveyden tutkimusta. Itä-Suomen Biopankki rekisteröitiin Valviran (nykyään Fimea) valtakunnalliseen biopankkirekisteriin 29.10.2015.
Biopankin johtaja: Arto Mannermaa
Data/IT: Timo Laitinen, laatu: Lilja Tikkanen, projektit: Hanna Kujala
Arto Mannermaa
Biopankin johtaja
Keski-Suomen Biopankki
Keski-Suomen Biopankin ovat perustaneet Jyväskylään Keski-Suomen sairaanhoitopiiri ja Jyväskylän yliopisto. Biopankin tutkimusalue kattaa biologisen, lääketieteellisen ja liikunta- ja terveystieteellisen tutkimuksen ja tuotekehityksen.
Keski-Suomen biopankkiin on kerätty kokoveri-, plasma-, ctDNA- ja kudosnäytteitä sekä niihin liittyvää tietoa vuoden 2018 alusta. Ennen vuotta 2013 Keski-Suomen keskussairaalan patologian yksikössä kerätyt FFPE-kudosnäytteet on myös siirretty biopankkiin. Kokoelmat sisältävät näytteitä esimerkiksi kolmoisnegatiivista rintasyöpää, keuhkosyöpää, ruuansulatuskanavan syöpiä ja nivelreumaa sairastavilta potilailta.
Biopankin tehtävä on palvella biopankkitutkimusta ja biopankin tutkimusalueeseen kuuluvaa tuotekehitystä, sekä tukea diagnostiikan ja hoidon kehitystä. Biopankin tarjoamiin palveluihin kuuluu myös laboratoriopalveluita, kuten DNA-eristys, näytelasien digitointi ja monikudosblokkien (TMA) valmistus. Keski-Suomen Biopankki rekisteröitiin Valviran (nykyään Fimea) valtakunnalliseen biopankkirekisteriin 29.10.2015.
Biopankista vastaava henkilö: Tiina Jokela
Data/IT: Tomi Lilja, Projektit/Laatu: Veera Avelin, Maarit Ahtiainen
Tiina Jokela
Biopankista vastaava henkilö
Pohjois-Suomen Biopankki Borealis
Pohjois-Suomen Biopankki Borealisin perustajia ovat Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri, Oulun yliopisto, Nordlab ja Lapin, Länsi-Pohjan, Keski-Pohjanmaan ja Kainuun sairaanhoitopiirit/sote-alueet. Biopankin tehtävänä on edistää biolääketieteellistä, kliinistä, translationaalista ja terveystieteellistä tutkimusta ja tuotekehitystä sekä tukea sairaanhoidon erityisvastuualueen (OYS-ERVA) diagnostiikan ja potilaiden hoidon kehitystä. Erityisesti tavoitteena on tukea hoidon vaikuttavuuteen tai sivuvaikutuksiin liittyviä tutkimuksia sekä patologisia löydöksiä hyödyntävää tutkimusta. Biopankissa on jatkuvasti kasvavia näytekokoelmia sekä mm. Finnish Maternity Cohort (FMC), joka sisältää yli 2 miljoonaa suomalaisilta äideiltä kerättyä raskaudenaikaista verinäytettä. Pohjois-Suomen Biopankki Borealis merkittiin Valviran (nykyään Fimea) rekisteriin 10.7.2015.
Biopankin johtaja: Raisa Serpi
Data/IT: Juha Kivelä ja Elli Heikura, laatu: Johanna Korvala, projektit: Anne-Mari Moilanen, tieteellinen johtaja: Raisa Serpi, varajohtaja: Pia Nyberg
- Aapistie 5B
- 90220 Oulu
- PL 50
- 90029 POHDE
Raisa Serpi
Tieteellinen johtaja / Biopankin johtaja
Pohjois-Suomen Biopankki Borealis
[email protected]+358 40 504 9025
Tampereen Biopankki
Tampereen Biopankin ovat perustaneet Pirkanmaan sairaanhoitopiiri, Tampereen yliopisto sekä Etelä-Pohjanmaan sairaanhoitopiirin kuntayhtymä ja Kanta-Hämeen sairaanhoitopiirin kuntayhtymä. Tampereen Biopankin tehtävänä on tukea sairauksien ennaltaehkäisyyn, potilaiden hoidon vaikuttavuuteen tai sivuvaikutuksiin liittyviä tutkimuksia sekä patologisia löydöksiä hyödyntäviä tutkimuksia. Tampereen Biopankki keskittyy erityisesti Tampereen yliopiston ja Taysin tutkimusstrategian mukaisiin tutkimushankkeisiin, joita ovat muun muassa sydän- ja verisuonitautien tutkimus, syöpätutkimus, autoimmuunisairauksien tutkimus sekä lapsuusiän diabeteksen tutkimus. Tampereen Biopankki on saanut Valviralta (nykyään Fimea) toimiluvan 8.9.2015.
Biopankin johtaja: Sanna Siltanen
Data/IT: Sami Niemelä, laatu: Sanna Siltanen, projektit: Enni Makkonen, viestintä: Sanna Siltanen
- Arvo Ylpön katu 6
- 33520 Tampere
- PL 2000
- 33521 Tampere
Sanna Siltanen
Biopankin johtaja
Tampereen Biopankki
[email protected]+358 3 311 65205
THL Biopankki
Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksessa (THL) toimiva THL Biopankki on valtakunnallinen biopankki, johon kerätään ja jossa säilytetään arvokkaita tutkimusaineistoja koko Suomen alueelta. THL Biopankki tarjoaa monipuolisia näyte- ja tietokokoelmia, jotka ovat yhdistettävissä kansallisiin rekistereihin ja kattaviin asiantuntijapalveluihin. Erityisesti tuetaan tutkimuksia, jotka selvittävät sairauksien syitä ja perimän, ympäristön ja elintapojen vaikutusta niihin, sekä tutkimuksia, joissa kehitetään uusia ratkaisuja terveyden edistämiseksi ja sairauksien ehkäisemiseksi. THL Biopankki sai toimiluvan sosiaali- ja terveysalan lupa- ja valvontavirastolta Valviralta (nykyään Fimea) 10.3.2014.
Biopankin johtaja: Tiina Wahlfors
Data/IT: Kaisa Silander, laatu: Minttu Sauramo, projektit: Katariina Peltonen, viestintä: Tiina Wahlfors, tieteellinen johtaja: Markus Perola
Tiina Wahlfors
Biopankin johtaja, viestintä
